A alternativa que preenche corretamente as lacunas é: Não o vejo _____ muito tempo, mas sei que ele vai embora daqui _____ pouco.

Vamos analisar cada lacuna:

1. “Não o vejo _____ muito tempo” Aqui a ideia é de tempo decorrido (“faz muito tempo que não o vejo”). Para indicar tempo passado/decorrido, usa-se o verbo haver no sentido de existir/tempo: há. Ex.: “Não o vejo há dois meses.”

2. “mas sei que ele vai embora daqui _____ pouco.” Aqui a ideia é de tempo futuro (“daqui a pouco” = em breve). Nessa expressão, usa-se a preposição a (sem acento): daqui a pouco.

Portanto, a forma correta é há / a. Alternativa correta: (e).